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产品概述
本产品为实时荧光定量 PCR 扩增的预混合溶液,反应液中已包含 Taq enzyme mix、SYBR Green I、dNTP、Mg2+、Rox 以及优化的缓冲体系, 配制 qPCR 反应时只需加入引物和模板即可进行扩增,减少了操作步骤,降低污染概率,提高了实验的可重复性及结果稳定性。
产品特点&优势
—通用性强:本产品已调整最优 ROX 添加比例,无需单独添加 ROX 染料,适用于不同型号荧光定量 PCR 仪;
—复杂模板兼容性好:除保证常规荧光定量扩增效果外,对于高 GC 含量(≤78%)的扩增片段,扩增效果极好;
—灵敏度高:对于高表达量基因(如内参),可在低至1pg的cDNA中检测到目的基因;
—稳定性好:本试剂经过严苛的反复冻融及温控实验,经20次反复冻融或在37℃条件下保存15天性能无明显下降;
—扩增效率高:试剂中添加了防止引物二聚体形成的优化因子,因此能够提高扩增效率;
产品组成
实验案例
1. 产品兼容性高,适用于不同qPCR仪
以293T细胞cDNA为模板,稀释10倍梯度在不同仪器上扩增基因A得到的扩增曲线及溶解曲线,如图所示,YoungGEN #QP101A可兼容不同机型:Step One Plus(High ROX)、Applied Biosystems QuantStudio 6 (Low ROX)、BIOER LineGene 9600 Plus(Without ROX)。
2. 基因适用范围广
以 293T 细胞 cDNA 为模板,分别采用正常 GC 含量(48%)(左)和高 GC 含量(78%)(右)引物序列进行测试,结果显示, YoungGEN #QP101A 梯度扩增良好、兼容性高、处于优势。
3. 稳定的平行性
以 293T 细胞 cDNA 为模板,选取β-actin 进行复孔平行性测试,如图所示,YoungGEN #QP101A平行性好,可靠程度高。
4. 梯度扩增灵敏度高
以293T细胞cDNA为模板,将50 ng/ul浓度模板进行6个10倍梯度稀释后扩增基因内参基因,得到如上所示的扩增曲线(左)。将6个梯度扩增所得CT值制成标准曲线(右),结果显示即使模板量低至1ng,仍然呈现极好的扩增效率。
5. 不同样本稳定性好
以鼠肝cDNA为模板,将50 ng/uL浓度模板进行6个10倍梯度稀释,在Step One Plus(High ROX)、Applied Biosystems QuantStudio 6 (Low ROX)、BIOER LineGene 9600 Plus(Without ROX)不同机型扩增基因B得到如上所示的曲线。
保存条件
-30~-15℃保存,干冰/-20℃运输。
1. 熔解曲线出现非特异峰
目的峰前面,Tm=75左右出现的峰为引物二聚体峰;紧挨着目的峰前后,有可能是非特异产物峰或者gDNA扩增峰;分析如下:
1) 引物设计不优,需根据设计原则设计合成新的引物。
2) 引物浓度太高:适当降低引物浓度。
3) 检测的目的基因同源家族基因较多,重新设计引物或采用探针法进行定量检测;
4) cDNA模板带有基因组污染:重新制备cDNA模板。
2. 扩增曲线形状异常
1) 扩增曲线不光滑:信号太弱,经系统矫正后产生。提高模板浓度重复实验。
2) 扩增曲线断裂或下滑:模板浓度较高,基线的终点值大于CT值。减小基线终点(C T值 - 4),重新分析数据。
3) 个别扩增曲线突然骤降:反应管内留有气泡。处理样本时要注意离心,进行扩增反应之前要仔细检查反应管内是否有气泡残留。
3. 反应结束无扩增曲线出现
1) 反应循环数不够:一般设置循环数为40,但需要注意的是过多的循环会增加过多的背景信号,降低数据可信度。
2) 确认程序中是否设置了信号采集步骤:两步法扩增程序一般将信号采集设置在退火延伸阶段;三步法扩增程序应当将信号采集设置在72°C
延伸阶段。
3) 确认引物是否降解:长时间未用的引物应先通过PAGE电泳检测完整性,以排除其降解的可能。
4) 模板浓度太低:减少稀释度重复实验,一般未知浓度的样品先从最高浓度做起。
5) 模板降解:重新制备模板,重复实验。
4. CT值出现太晚
1) 扩增效率极低:优化反应条件,尝试三步法扩增程序,或者重新设计合成引物。
2) 模板浓度太低:减少稀释度重复实验,一般未知浓度的样品先从最高浓度做起。
3) 模板降解:重新制备模板,重复实验。
4) PCR产物太长:推荐PCR产物长度为80-150 bp。
5) 体系中存在PCR抑制剂:一般为模板带入,加大模板稀释倍数或者重新制备模板重复实验。
5. 阴性对照出现明显扩增
1) 反应体系污染:更换新的Mix、ddH 2 O、引物重复实验。反应体系在超净工作台内配制,减少气溶胶污染。
2) 引物二聚体的出现:配合熔解曲线进行分析。
6. 绝对定量时标准曲线线性关系不佳
1) 加样误差:提高模板稀释倍数,提高加样体积。
2) 标准品降解:重新制备标准品,重复实验。
3) 模板浓度太高:提高模板稀释倍数。
7. 实验重复性差
1) 加样体积失准:使用性能较好的移液枪;将模板做高倍稀释,以大体积加入反应体系中。
2) 定量PCR仪不同位置温度控制不一致:定期校准仪器。
3) 模板浓度太低:模板浓度越低,重复性越差,减少模板稀释度或提高加样体积。
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